南瓜籽富含鎂和鋅，兩種極重要的礦物質。鎂對心臟、關節、腸道和骨骼的健康很有幫助。鋅對消化、皮膚、提升免疫力和傷口的復原有幫助，並有保護前列腺功效。南瓜籽富含蛋白質氨基酸，其中的色胺酸 (tryptophan) 用作轉化為血清素 (seratonin) 再變成褪黑色素 (melatonin)，有助促進睡眠。另南瓜籽含亞麻酸在體內可轉化爲奧米加三脂肪酸，有抗炎及保護細胞功效。